2006金馬獎全新定位，為拓展視野、符合繁華盛開的文化精神，將原【年度最佳台灣電影】及【年度最佳台灣電影工作者】獎項更名為【福爾摩沙影片獎】與【福爾摩沙個人獎】，並訂定完整的競賽規則，讓此獎項更具有競爭性與榮耀。
有鑒於過去歷年金馬獎所頒發【評審團大獎】、【評審團特別獎】、乃至於【年度最佳台灣電影】、【年度台灣最佳電影工作者】，立意良好卻予人模糊不清印象，電影基金會與金馬執委會特地重新開會研議獎項規則，決議讓此獎項規模與視野更宏大，希望釐清以往媒體與電影界人士對此獎項的誤解。
因此除了更名【福爾摩沙影片獎】與【福爾摩沙個人獎】外，更賦予鼓勵性的條文規則，增加【入圍名單】的角逐制度，由本土初選評審遴選出至多三部最能肯定台灣電影成績之作，讓此項獎成為正規競賽獎項，入圍者也能感受到其競爭性，得獎者更能感受其尊榮。
再來，則是放寬影片之入圍資格，任何影片只要符合六項條件中之三項，便有資格入圍與角逐【福爾摩沙影片獎】，以增加影片廣度與深度的競爭性，及鼓勵國際與台灣電影的跨國合作。只有個人獎項部分，依然是針對年度最優秀的中華民國電影幕前幕後從業人員給予鼓勵。
福爾摩沙獎項相關細則如下─
獎項名稱
〈影片部分〉：福爾摩沙影片獎。
〈個人部分〉：福爾摩沙個人獎。
入圍名單
〈影片部分〉：影片至多三名。
〈個人部分〉：個人至多三名。
入圍資格
〈影片部分〉須符合以下至少三項條件：
1. 出品公司其中之一須為台灣登記有案者，或出品人其中之一須持有中華民國國民身分證。
2. 導演之一須持有中華民國國民身分證。
3. 二分之一以上重要演員(主配角合計)須持有中華民國國民身分證。
4. 二分之一以上工作人員須持有中華民國國民身分證。
5. 二分之一以上主要拍攝場景位於台灣。
6. 影片內容以台灣文化背景為主。
〈個人部分〉：
1. 須持有中華民國國民身分證。
※附註：
1. 所有影片類別皆可角逐
2. 資格之認定如有爭議，將交由評審團決議。
入圍及得獎權利
〈影片部分〉：
1. 入圍者核給獎金新台幣伍萬元及證書壹份。
2. 得獎者核給獎金新台幣參拾萬元，獎給金馬獎獎座壹座。
〈個人部分〉：
1. 入圍者證書壹份。
2. 得獎者核給獎金新台幣壹拾萬元，獎給金馬獎獎座壹座。
