阿勇原是黑社會老大的得力助手，在為老大的女人麗紅施救時，被老大誤以為玷污麗紅，從此走上逃亡之路；大顆與小粒是幫派裡不起眼的小嘍囉，在出任務時被一哥設計，當了代罪羔羊而不自知，從此淪為黑道亟欲滅口的對象。

在阿勇逃亡的過程中意外結識大顆與小粒，三人陰錯陽差地結為莫逆，並研討出唯一的救命之道是上山避難，遁入佛門。少林寺的方丈早已推算出三人會有此劫難，但在收留三人之前，仍刻意製造難題，修法比試。比試分文、武兩場：文場比對聯，武場比朝拜禮、悶水、踢足球，三人無一過關，按理說應被驅逐少林，但經三人懇求，方丈終於首肯收留，從此對三人嚴格管教，並展開一連串的訓練。

阿勇三人起初學習態度散漫、目中無人，不管在朱和尚的悟性教學，或者是大師兄的少林功夫指導時，皆吃足苦頭。後來，大師兄以真實、高強的功夫底子懾服三人，三人從此一反常態，努力學習。然而在夜晚時分、筋疲力盡卻無法成眠之際，三人因禁不起磨練，還是興起了逃離少林的念頭。第一次逃離時，阿勇三人被大師兄逮個正著，三腳貓的功夫自然敵不過大師兄，很快地就被抓回。

第二次逃離時，阿勇三人不再力敵，而改採智取，果然奏效。三人在順利逃離少林後，並未從此一帆風順，反而重蹈覆轍，再次陷入黑道的追殺。在千鈞一髮之際，小和尚出現，適時搭救三人，重返少林。阿勇三人返回少林後，原以為會被制裁，沒想到方丈、大師兄皆未計較，反而關心三人在山下是否習慣。此舉讓阿勇三人抱定決心，從此潛心修行，不學會少林功夫絕不下山。

阿勇三人專心練功，與眾僧相處和諧、感情激進，也因此發現原來大顆與小粒曾前去要債的朱家，正是朱和尚的家。阿勇三人在夜半省思時，除了深感愧對朱家外，更意外發現三人之所以成為被追殺的對象，乃是老大一手主導，因此抱著「撥亂反正」的心態，懇求方丈放行。方丈謂三人佛緣已盡，是該下山將塵世間的事情做個了斷，因此阿勇三人在眾僧的祝福下，離開少林，返回塵世。

阿勇三人首先闖入老大的家，逼迫麗紅錄下自白錄音帶，蒐集確實的罪證。在老大返家時，阿勇因勸麗紅一起出走不成，反倒落入老大手中，成為交換錄音帶的人質。交換人質時，阿勇三人勢單力薄、寡不敵眾，幸賴小和尚再次出現，為三人解圍。老大一幫人在大批警力的圍捕下，全數落網，惡勢力終告失敗。

阿勇三人改邪歸正，重返少林答謝方丈。最後阿勇進入演藝圈，娛樂大眾；大顆投入社教工作，造福人群；小粒成為警民合作的橋樑：線民，為社會除害。三人各攜禮物獻給方丈、大師兄以及小沙彌，唯獨朱和尚落空。就在朱和尚抱怨連連時，父親朱無謀帶著全家人出現，朱和尚才破啼為笑，感謝三人用心良苦。正當阿勇三人欲離去時，又來了三個黑道份子上山求救，方丈及眾僧好不容易放鬆的情緒，又再次緊繃。